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“材化讲坛”第18讲——机器学习组合模型于多肽全文库挖掘高性能抗菌肽

2023-04-12  点击:[]


报告时间:2023414日下午1330

报告地点:宁波大学北区1号实验楼(慎思楼)227会议室

报告人:黄俊杰 博士

报告人简介

黄俊杰  浙江大学高分子系博士后,宁波大学博彩导航 毕业生(分别获学士和硕士学位),于2021年在浙江大学高分子系取得博士学位。长期从事机器学习加速材料研发以及高通量实验加速材料研发领域,以第一作者身份在Nature Biomedical Engineering, ACS Applied Materials & Interfaces等期刊发表多篇论文。于2022年获杭州青山湖材料基因工程青年科学家奖,浙江大学国际校区年度学术成果奖,浙江大学国际校区年度优秀学术新人奖。

 

报告摘要:具有序列多样性的多肽分子构成了一个极其巨大的潜在治疗药物储藏库。然而即使使用最先进的实验技术,为新药候选识别整个肽库空间仍然是一项艰巨的任务。在这项研究中,作者以抗菌肽识别为例,报道一个由经验判断、分类、排序和回归任务组成的全新机器学习pipeline,实现在六肽-九肽全多肽序列全文库超过5000亿样本中高效挖掘强效抗菌肽,仅耗时27天即可完成从抗菌肽识别到湿实验测试全流程,成功率高达98.1%。其中3条最强抗菌六肽表现出高杀菌活性、广谱杀菌性,低脱靶毒性、不易诱导耐药性、更能治疗小鼠细菌性肺炎,具有重要临床应用前景。

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